PCクラスタ

PCクラスタは2025年3月1日をもってサービス終了しました。

学内ネットワークに接続したコンピュータより、SSHを用いて接続を行います。
接続後は、CentOS のCUIで操作できます。

接続先ホスト名

pcc-mgr.isc.meiji.ac.jp

　ジョブクラスで使用できるCPU数は以下のとおりです。

MPIジョブ

ジョブクラス	ジョブで使用できるCPU（コア）数	一人で使用できる最大CPU（コア）数	最大ジョブ経過時間 （デフォルト値）
MPI_S	288	576	10時間以下 （1時間）
MPI_L	288	576	7日間以下 （10時間）

　※旧PCクラスタのジョブクラスＡ，Ｂ，Ｃも使用できます。（後方互換性のため）
　　この場合、ジョブクラスＡとＢはＭＰＩ＿Ｓに、ジョブクラスＣはＭＰＩ＿Ｌと同じ制約条件となります。

OpenMPジョブ

ジョブクラス	キュー名	ジョブで使用できるCPU （コア）数	一人で使用できる 最大CPU（コア）数	最大ジョブ経過時間 （デフォルト値）
OpenMP	OpenMP	32	64	—

• PCクラスタは、研究活動を支援するためのコンピュータ設備です。
  授業等、教育目的でのご利用はできません。（教育用情報処理室ならびに情報処理教室、生田オープンＰＣ等をご利用ください。）
• PCクラスタ管理用サーバ(pcc-mgr.isc.meiji.ac.jp)上での長時間ジョブの実行は禁止します。
  MPIやOpenMPを用いた並列ジョブでは無いプログラムは、IA/Linux高速スカラ演算サーバをご利用ください。

機種名	富士通 PRIMERGY RX2530 M4
ＣＰＵ（１ノードあたり）	インテル Xeon Gold 6142 (2.60GHz/16コア/22MB) x 2モジュール
メモリ（同上）	96GB
台数（総ノード数/総コア数）	24ノード/768コア

Red Hat Enterprise Linux 7.6	管理ノードOS
CentOS 7.6	計算ノードOS
インテルParallel Studio XE Cluster Edition	クラスタ向け開発ツールスイート
IBM Platform LSF 10	クラスタ管理ソフト
HPCポータル	クラスタ管理GUI
Jaguar / QSite	量子化学計算 / QM/MM計算
PGIコンパイラ	PCクラスタ用ソフトウェア開発キット
R	統計解析
OpenFOAM	流体/連続体シミュレーション
MATLAB	数値解析/技術計算言語

・PCクラスタ（pcc-mgr.isc.meiji.ac.jp）および スカラ演算サーバ（isc-iasrv.isc.meiji.ac.jp）には、計算中のデータ等を一時的に保存するための領域（データ一時保存領域(hpc_share)）が用意されています。
・データ一時保存領域のディレクトリ名は、/hpc_share　です。（約18TB）
・/hpc_shareの利用に際しては、以下の点にご注意ください。
　＊　/hpc_shareに保存したデータは、計算終了後、速やかに自分のホームディレクトリ等へ移動の上、削除してください。
　＊　/hpc_shareに長期間保存されているデータは、予告なく、生田メディア支援事務室にて消去する場合があります。

・「新PCクラスタの利用について」　2019.3.10、生田メディア支援事務室
・「PCクラスタシステム　利用手引書」　2019.4.1、生田メディア支援事務室
・「HPCポータル簡易ガイド」　2019.4.1、生田メディア支援事務室
・「Jaguar/qsite簡易ガイド」　2019.3.11、生田メディア支援事務室
・「並列計算機入門 1 PCクラスタ編」（実習レジメ）　2019年度春期生田システム講習会資料（学内のみアクセス可能）
・「MATLAB 並列計算１ PCクラスタ連携編」（PCクラスタ連携のためのMATLAB設定手順）　2020年度春期生田システム講習会資料（学内のみアクセス可能）